Mengingat pentingnya penilaian akurasi dan validasi secara ilmiah dalam pengolahan data penginderaan jauh, MapBiomas Indonesia telah menyelesaikan validasi dan penilaian akurasi untuk Koleksi 2.0. Selain menunjukkan akurasi klasifikasi secara keseluruhan, analisis ini juga menunjukkan akurasi dan tingkat kesalahan untuk setiap kelas yang diklasifikasikan. MapBiomas mengevaluasi akurasi klasifikasi global dan per kelas untuk setiap tahun antara tahun 2000 – 2022.

Estimasi akurasi didasarkan pada evaluasi sampel piksel, yang kami sebut sebagai data referensi yang terdiri dari ~12.957 sampel. Yang sebelumnya ditentukan dengan teknik pengambilan sampel secara statistik. Proses validasi data referensi ini melibatkan 10 perguruan tinggi di Indonesia: Universitas Syiah Kuala, Universitas Bengkulu, dan Universitas Lampung di Sumatera; Universitas Muhammadiyah Palangkaraya dan Universitas Mulawarman di Kalimantan; Universitas Tadulako di Sulawesi; Universitas Papua; serta Universitas Indonesia, Universitas Gajah Mada, dan Institut Pertanian Bogor di Jawa. Akurasi dinilai dengan menggunakan matriks galat (error matrix) yang membandingkan kelas tutupan lahan dipetakan dengan kelas sampel tutupan lahan tervalidasi.